Malgré la Nuit gaat over een liefdesrelatie, of beter gezegd een bizarre driehoeksverhouding.
Lenz verlaat Engeland en keert terug naar Parijs op zoek naar zijn geliefde Madeleine, die onder onzekere omstandigheden verdween. Hij ontmoet Helena, een verpleegster die nog steeds worstelt met het verlies van haar zoontje.